از وقتی نوت‌پد++ خودم را به نسخه ۵.۳.۱ که یونیکد را پشتیبانی می‌کند نصب کرده‌ام، افزونه Compare آن (نسخه ۱.۵.۴) از کار افتاده و با این نسخه از نوت‌پد++ سازگار نیست.
اگر شما هم این مشکل را دارید از ComparePlugin1.5.2.unicode.zip استفاده کنید.